Для использования функционала НДС необходимо:
При необходимости отображения суммы НДС для всех позиций в редакторе чека необходимо добавить переменную %VATSum%.
По-умолчанию для всей номенклатуры добавлен НДС 20%. Для изменения ставки НДС у одной позиции номенклатуры необходимо в разделе "Справочники: Номенклатура" в меню правой кнопки мыши нажать пункт "Изменить" и указать нужную ставку НДС.
Далее необходимо выбрать нужную ставку НДС и целевой группы номенклатуры.